Ο πεπτιδικός δεσμός είναι ένας ομοιοπολικός δεσμός ο οποίος δημιουργείται μεταξύ δύο μορίων όταν η καρβοξυλομάδα ενός αντιδρά με την αμινομάδα του άλλου μέσω αντίδρασης συμπύκνωσης (ή αφυδάτωσης, η οποία οδηγεί - δηλαδή - στην εξάλειψη ενός μορίου νερού ).
Συνήθως, ο πεπτιδικός δεσμός σχηματίζεται μεταξύ δύο αμινοξέων, που προέρχονται από ένα διπεπτίδιο.
Επειδή στο μόριο του ένα διπεπτίδιο εξακολουθεί να περιλαμβάνει μία αμινομάδα και μία καρβοξυλική, μπορεί να σχηματίσει έναν πεπτιδικό δεσμό με ένα τρίτο αμινοξύ που προέρχεται από ένα τριπεπτίδιο και ούτω καθ 'εξής. Όταν ο αριθμός των αμινοξέων είναι σχετικά μικρός ονομάζεται ολιγοπεπτίδιο, ενώ εάν ο αριθμός των αμινοξέων αυξάνεται, ονομάζεται πολυπεπτίδιο ή πρωτεΐνη.
Στην πραγματικότητα, παρά το σχήμα, ο πεπτιδικός δεσμός δεν είναι απλός, αλλά παρουσιάζει για 60% μία απλή φύση συνδέσεως και για 40% μία φύση διπλού δεσμού.
Στους ζώντες οργανισμούς, ο σχηματισμός του πεπτιδικού δεσμού καταλύεται από ένα ένζυμο - που ονομάζεται πεπτιδυλ τρανσφεράση - που υπάρχει στη βασική υπομονάδα των ριβοσωμάτων.
Ακόμη και οι πρωτεΐνες που εισάγονται στη δίαιτα αποτελούνται από αλυσίδες αμινοξέων συνδεδεμένα με πεπτιδικούς δεσμούς. Κατά την πέψη, οι δεσμοί αυτοί διασπώνται από συγκεκριμένα ένζυμα (πεπτιδάσες) που υπάρχουν στους γαστρικούς και παγκρεατικούς χυμούς. Τα απλά αμινοξέα, αφού απορροφηθούν από το έντερο, περνούν από το αίμα και συλλαμβάνονται από τα κύτταρα - κυρίως από τα συκώτια - τα οποία τα ενώνουν μέσω νέων δεσμών πεπτιδίων για να σχηματίσουν τις πρωτεΐνες που χρειάζονται (όχι μόνο δομικές, αλλά και ορμονικές, ενζυμικές, κλπ. .). Στη φύση, στην πραγματικότητα, υπάρχει ένας μεγάλος αριθμός πρωτεϊνών, με διαφορετικά φυσικοχημικά χαρακτηριστικά, τα οποία προέρχονται από τις διαφορετικές ιδιότητες των 20 συνηθισμένων αμινοξέων και από τον τρόπο με τον οποίο συνδυάζονται στην πολυπεπτιδική αλυσίδα. Αρκεί να πούμε ότι μια πρωτεΐνη των 100 αμινοξέων, επομένως σχετικά μικρή, μπορεί να αποτελείται από 20100 = 1.27 χ 10130 πιθανές πολυπεπτιδικές αλυσίδες. Οι οδηγίες για την κατασκευή της σωστής αλυσίδας αμινοξέων περικλείονται στο γονιδίωμα του ατόμου.
