Η λήψη αντισυλληπτικού χάπι μπορεί να επηρεάσει τα επίπεδα χοληστερόλης στο αίμα. Το βάρος αυτού του αποτελέσματος εξαρτάται από τον τύπο του αντισυλληπτικού που χρησιμοποιείται, ειδικότερα από τη συγκέντρωση των οιστρογόνων και των προγεστίνων. Τα οιστρογόνα που περιέχονται στα αντισυλληπτικά χάπια φαίνεται να αυξάνουν ελαφρώς τα επίπεδα της καλής χοληστερόλης (HDL), μειώνοντας παράλληλα την κακή (LDL). το τελικό αποτέλεσμα είναι ελαφρά αύξηση της ολικής χοληστερόλης, συνοδευόμενη από σημαντική αύξηση των τριγλυκεριδίων. Τα προγεσταγόνα που περιέχονται στα αντισυλληπτικά χάπια θα έχουν αντίθετο αποτέλεσμα, δεδομένης της τάσης αύξησης της LDL χοληστερόλης μειώνοντας την ποσόστωση HDL.