Επί του παρόντος, δεν υπάρχει διαθέσιμο εμβόλιο ή φάρμακο για την προφύλαξη κατά της τρυπανοσωμίας στην Αφρική . Επομένως, τα προληπτικά μέτρα αποσκοπούν στην ελαχιστοποίηση της επαφής με τις μύγες τσεζ-τσε.
Πρώτον, οι μολυσμένες περιοχές πρέπει να αποφεύγονται. Η μύγα tsetse είναι λιγότερο ενεργή στις πιο ζεστές ώρες της ημέρας, αλλά μπορεί να επιτεθεί αν είναι ενοχλημένη. Θα πρέπει να θυμόμαστε ότι αυτό το έντομο προσελκύεται από κινούμενα αντικείμενα και φωτεινά ή σκούρα χρώματα. Μπορεί επίσης να τσιμπήσει με ελαφρά ρούχα. Ως εκ τούτου, συνιστάται να φοράτε πουκάμισα και παντελόνια που καλύπτουν τα άκρα όσο το δυνατόν περισσότερο. Ειδικότερα, προτιμώνται τα ρούχα από ανθεκτικό υλικό και ουδέτερα χρώματα που συνδυάζονται με το περιβάλλον. Η εφαρμογή απωθητικών στα ρούχα μπορεί επίσης να είναι χρήσιμη. Τα σμήνη των μύλων tse-tse μπορούν να ακολουθήσουν τα κινούμενα οχήματα, επομένως είναι προτιμότερο να κλείνουν τα παράθυρα του αυτοκινήτου για να αποφευχθεί η εισβολή τους στην καμπίνα.
Η καταπολέμηση του φορέα εντόμων μπορεί να πραγματοποιηθεί σε περιβαλλοντικό επίπεδο με την καταστροφή των ενδιαιτημάτων αναπαραγωγής, τη χρήση εντομοκτόνων και παγίδων (καλύτερα εάν εμποτιστούν με permethrin) στις θέσεις καταφυγίου για μύγες tse-tse (scrub savannah) και βλάστηση κατά μήκος των υδάτων) και τη θεραπεία των παρασιτοποιημένων ατόμων (πηγή μόλυνσης για τους φορείς).
