Τα πρώτα κύτταρα που επηρεάζονται από τον ιό Ebola είναι σημαντικά για την ανοσολογική άμυνα του μολυσμένου ατόμου. Ο μικροοργανισμός αποτρέπει, ειδικότερα, την ενεργοποίηση μιας αντίδρασης από μονοκύτταρα, μακροφάγα και δενδριτικά κύτταρα. Κατά κανόνα, αυτά τα κύτταρα αναγνωρίζουν ότι κάτι ξένο έχει εισέλθει στο σώμα, έτσι έχουν το κρίσιμο καθήκον ενεργοποίησης του ανοσοποιητικού συστήματος .
Συνεπώς, η λοίμωξη καθιστά δύσκολη την ανάπτυξη μιας αποτελεσματικής απάντησης για την καταπολέμηση του ιού Ebola, η οποία μπορεί έτσι να πολλαπλασιαστεί για να εισβάλει στα κύρια όργανα του σώματος, αφήνοντας ελάχιστες πιθανότητες επιβίωσης.
