Η διάγνωση της τοξοπλάσμωσης βασίζεται κυρίως στην έρευνα και τον ποσοτικό προσδιορισμό ειδικών αντισωμάτων (IgM και IgG) με έμμεσο ανοσοφθορισμό ( IFA ) ή ανοσοενισχυτικό προσδιορισμό ( EIA ).
Το IgM αντι-τοξόπλασμα εμφανίζεται κατά τη διάρκεια των πρώτων 2 εβδομάδων οξείας νόσου, με αιχμή μεταξύ της τέταρτης και της όγδοης εβδομάδας, πριν καταστεί απροσδιόριστο (μόνο σε ορισμένες περιπτώσεις, μπορεί να βρεθεί μέχρι τον 18ο μήνα μετά τη μόλυνση) . Ειδικά IgGs, από την άλλη πλευρά, σχηματίζονται πιο αργά, κορυφώνουν σε 1-2 μήνες και μπορούν να παραμείνουν υψηλές και σταθερές για μήνες ή χρόνια. Σε ένα υγιές άτομο, η προηγούμενη λοίμωξη παράγει μια αρνητική εξέταση Toxo για IgM και μια θετική IgG.
Η παρουσία του Toxoplasma gondii μπορεί να αποδειχθεί με ιστολογικές εξετάσεις, καλλιέργεια και PCR για παράσιτο DNA σε δείγματα ιστών και οργανικά υγρά (αίμα, CSF και αμνιακό υγρό). Εκτός από αυτές τις εξετάσεις, ορισμένες στοχευμένες οργανικές έρευνες, όπως η ηλεκτρονική τομογραφία, η απεικόνιση μαγνητικού συντονισμού, ο υπέρηχος και η οφθαλμοσκόπηση, μπορεί να συμβάλουν στην επιβεβαίωση της υποψίας τοξοπλάσμωσης.
