Από 2 έως 21 ημέρες μετά τη μόλυνση, τα πρώτα συμπτώματα του εβολά να εμφανιστούν είναι ο πυρετός, η έντονη αδυναμία, ο πόνος των αρθρώσεων και των μυών, ο πονοκέφαλος και η λαρυγγίτιδα, ακολουθούμενη από έμετο, διάρροια και κοιλιακό άλγος. Από την πέμπτη έως την έβδομη ημέρα, μπορεί να αναπτυχθεί ένα χαρακτηριστικό εξάνθημα, με κηλίδες και μικρές φυσαλίδες.
Καθώς η νόσος εξελίσσεται, ηπατική ή νεφρική ανεπάρκεια, μπορεί να εμφανιστούν προβλήματα πήξης και αιμορραγία από τις γαστρεντερικές βλεννογόνους και τα γεννητικά όργανα. Ο ασθενής έχει συνήθως μεταξύ 6 και 16 ημερών για να πολεμήσει και να νικήσει τον ιό, διαφορετικά η σοβαρή αιμορραγία και η καρδιαγγειακή κατάρρευση μπορεί να οδηγήσουν σε θάνατο. Η θνησιμότητα ποικίλει ανάλογα με το στέλεχος του ιού Ebola και την παρεχόμενη περίθαλψη.
