Η διάγνωση του κίτρινου πυρετού δεν είναι απλή, καθώς η κλινική εικόνα μπορεί να παρουσιαστεί με ένα σύμπτωμα δύσκολο να διακριθεί από αυτό των άλλων ιογενών αιμορραγικών πυρετών, της ελονοσίας, του τυφοειδούς πυρετού, της λεπτοσπείρωσης, του δάγκειου πυρετού και της ηπατίτιδας.
Επομένως, πρέπει να υπάρχει υποψία κίτρινου πυρετού σε ασθενείς σε ενδημική περιοχή που εμφανίζουν ξαφνικό πυρετό με βραδυκαρδία και ίκτερο. Οι εργαστηριακές εξετάσεις που διεξάγονται αμέσως σε εξειδικευμένο νοσοκομείο θα επιτρέψουν την επιβεβαίωση ή την εξαφάνιση της διάγνωσης.
Οι έρευνες που είναι χρήσιμες για το σκοπό αυτό περιλαμβάνουν τον αριθμό αίματος, την ανάλυση ούρων, τις δοκιμασίες ηπατικής λειτουργίας, τις κυτταρικές καλλιέργειες και την αναδρομική μεταγραφή με αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης (RT-PCR). Διαγνωστική επιβεβαίωση παρέχεται από την παρουσία ειδικών αντισωμάτων που ανιχνεύονται με ορολογικές δοκιμές, όπως η ELISA (ενζυμική ανοσοπροσροφητική δοκιμασία).
