Ο κίτρινος πυρετός μπορεί να προληφθεί με εμβολιασμό που παρέχει μακροχρόνια ανοσία (πάνω από 10 χρόνια), αποτελεσματική στο 90-95% των ασθενών.
Το εμβόλιο, που έχει εγκριθεί από την Παγκόσμια Οργάνωση Υγείας, αποτελείται από τον ζωντανό και εξασθενημένο ιό του κίτρινου πυρετού 17D, που αναπτύσσεται σε έμβρυο κοτόπουλου. Το εμβόλιο χορηγείται ως ένεση μίας δόσης στον άνω βραχίονα, το οποίο ανανεώνεται κάθε 10 χρόνια. Τα προστατευτικά αντισώματα εμφανίζονται 7-10 ημέρες μετά τον εμβολιασμό.
Ο εμβολιασμός, πέραν του ότι είναι υποχρεωτικός σε ορισμένους προορισμούς, συνιστάται ωστόσο για ταξιδιώτες που ταξιδεύουν σε ενδημικές περιοχές της Αφρικής και της Αμερικής. Το εμβόλιο κίτρινου πυρετού, από την άλλη πλευρά, αντενδείκνυται σε παιδιά πριν από 4 μήνες και σε έγκυες γυναίκες. ιδιαίτερη προσοχή συνιστάται επίσης σε άτομα που είναι αλλεργικά σε πρωτεΐνες κοτόπουλου ή αυγών, σε ανοσοκατασταλμένα άτομα λόγω ασθενειών ή θεραπειών, σε παιδιά κάτω των 9 μηνών και σε ηλικιωμένους ασθενείς.
