Αν και με αυτή την έννοια είναι λιγότερο επικίνδυνο από το αλκοόλ, ακόμη και η καφεΐνη μπορεί να ενισχύσει τις παρενέργειες ορισμένων φαρμάκων ή να μεταβάλει τη λειτουργία της.
Η καφεΐνη εξουδετερώνει τη δράση των φαρμάκων στην αϋπνία, αντισταθμίζοντας τα ηρεμιστικά τους αποτελέσματα και την αυξανόμενη δυσκολία στον ύπνο.
Σε άτομα που λαμβάνουν θεραπεία με θεοφυλλίνη, αμινοφυλλίνη ή άλλα σχετικά βρογχοδιασταλτικά ξανθίνης, η καφεΐνη μπορεί να προκαλέσει διέγερση, ταχυκαρδία, τρόμο και νευρικότητα.
Η καφεΐνη αυξάνει επίσης τον κίνδυνο παρενεργειών ορισμένων φαρμάκων που χρησιμοποιούνται στην ψυχιατρική, όπως η αντιψυχωτική κλοζαπίνη. μειώνει επίσης τα επίπεδα λιθίου στο πλάσμα.
Τα αντιβιοτικά της κινολόνης, όπως η ενοξακίνη, η σιπροφλοξαξίνη, η γκράπαφλοξασίνη, η λεβοφλοξασίνη και η νορφλοξασίνη, προκαλούν την αύξηση της καφεΐνης στο σώμα (υψηλές δόσεις καφεΐνης στο σώμα μπορεί να προκαλέσουν προβλήματα με ναυτία, εμετό, νευρικότητα, άγχος, ταχυκαρδία και σπασμούς).
Η καφεΐνη αλληλεπιδρά με αναστολείς ΜΑΟ, αυξάνοντας τις επιδράσεις διέγερσης στο συμπαθητικό. Κατά συνέπεια, μπορεί να υπάρχουν επεισόδια καρδιακών αρρυθμιών ή σοβαρής υπέρτασης λόγω του συνδυασμού αναστολέων ΜΑΟ και καφεΐνης.
Σε άτομα που λαμβάνουν αντιπηκτικά (κουμαδίνη - βαρφαρίνη), η δράση κατά της συσσωματώσεως της καφεΐνης αυξάνει τον κίνδυνο αιμορραγίας.
Η καφεΐνη μειώνει την αποτελεσματικότητα των φαρμάκων που χρησιμοποιούνται για την καταπολέμηση της ακράτειας ούρων.
Στην περίπτωση σύνδεσης με ΜΣΑΦ, η καφεΐνη μπορεί να ενισχύσει το γαστρεντερικό αποτέλεσμα του τελευταίου.
Τα επίπεδα της καφεΐνης στον ορό μπορούν να αυξηθούν με την ταυτόχρονη χρήση αντισυλληπτικών από το στόμα.
Ας θυμηθούμε, τέλος, ότι η καφεΐνη περιέχεται όχι μόνο στον καφέ, αλλά και σε πολλά τρόφιμα, όπως η κόκα κόλα, τα ενεργειακά ποτά και το τσάι, καθώς και σε ορισμένα συμπληρώματα διατροφής (για παράδειγμα αυτά που περιέχουν κόλα, ματέ ή γκουαράνα).
