Η αιτιοπαθογένεση ορίζεται ως η ανάλυση των αιτίων και της ανάπτυξης μιας παθολογίας ή μιας μη φυσιολογικής κατάστασης. Ο όρος προέρχεται από την ένωση της «αιτιολογίας» και της «παθογένεσης», η οποία στο ιατρικό πεδίο δείχνει, αντίστοιχα, τους αιτιώδεις παράγοντες (αιτιολογία) και τον μηχανισμό εμφάνισης και επακόλουθης ανάπτυξης μίας παθολογικής διαδικασίας (παθογένεσης).